Erreicht wird dies über eine Baumstruktur, in welcher die einzelnen Mandanten in unterschiedlichen hierarchischen Ebenen abgebildet werden. Domains hängen immer an einem Mandanten des Baumes und können auch nur von diesem bzw. einem übergeordneten Mandanten eingesehen und bearbeitet werden. Vergleichbares gilt für Benutzer-Accounts, welche den Mandanten von Benutzern auf gleicher oder übergeordneter Ebene zugewiesen werden. Dem neuen Benutzer können maximal die Rechte erteilt werden, die der anlegende Benutzer inne hat.
Ein Mandant kann selbst als Reseller fungieren und Domains an seine Kunden weiterverkaufen. Dabei kann er seinen kompletten Kundenstamm in DomiNIC abbilden und die Baumstruktur nach unten erweitern. Über die Resellerverwaltung können zahlreiche Eigenschaften konfiguriert werden, wie beispielweise die Verkaufpreise des Resellers. Der Reseller kann den vollen Funktionsumfang der DomiNIC Domain- und Kundenadministration für seine Kunden nutzen und das Layout der Anwendung wie auch die automatisch zu generierenden Dokumente seinem eigenen Corporate Design anpassen.